MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	AGC	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663757
2	NC_007351	TCA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663757
3	NC_007351	GCC	2	6	149	154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73663757
4	NC_007351	CAA	2	6	157	162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663757
5	NC_007351	CAA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663757
6	NC_007351	ACC	2	6	215	220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73663757
7	NC_007351	ATC	2	6	341	346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663757
8	NC_007351	TAG	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663758
9	NC_007351	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	73663758
10	NC_007351	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663758
11	NC_007351	AACAA	2	10	863	872	80 %	0 %	0 %	20 %	73663758
12	NC_007351	TAA	2	6	923	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663758
13	NC_007351	AAT	2	6	954	959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663758
14	NC_007351	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663758
15	NC_007351	ATAAG	2	10	1124	1133	60 %	20 %	20 %	0 %	73663758
16	NC_007351	TTA	2	6	1176	1181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663758
17	NC_007351	CAT	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663758
18	NC_007351	ATT	3	9	1212	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663758
19	NC_007351	TTC	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
20	NC_007351	TCA	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
21	NC_007351	TAA	2	6	1416	1421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
22	NC_007351	AAT	2	6	1435	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
23	NC_007351	T	6	6	1455	1460	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
24	NC_007351	TCC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663759
25	NC_007351	GAA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663759
26	NC_007351	TCC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663759
27	NC_007351	ACC	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73663759
28	NC_007351	GTA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
29	NC_007351	GAT	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
30	NC_007351	AAAT	2	8	1673	1680	75 %	25 %	0 %	0 %	73663759
31	NC_007351	TGA	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
32	NC_007351	ACA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663759
33	NC_007351	ATA	2	6	1780	1785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
34	NC_007351	AAC	2	6	1798	1803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663759
35	NC_007351	TAT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
36	NC_007351	TAA	2	6	1875	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
37	NC_007351	TAA	2	6	1890	1895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
38	NC_007351	TGCT	2	8	1934	1941	0 %	50 %	25 %	25 %	73663759
39	NC_007351	T	6	6	2013	2018	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
40	NC_007351	TCG	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663759
41	NC_007351	CTTT	2	8	2158	2165	0 %	75 %	0 %	25 %	73663759
42	NC_007351	GTATT	2	10	2228	2237	20 %	60 %	20 %	0 %	73663759
43	NC_007351	TGT	2	6	2250	2255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663759
44	NC_007351	TGT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663759
45	NC_007351	ATG	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
46	NC_007351	ATA	2	6	2337	2342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
47	NC_007351	AT	3	6	2368	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	73663759
48	NC_007351	AGT	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
49	NC_007351	TAA	2	6	2517	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
50	NC_007351	ACATC	2	10	2525	2534	40 %	20 %	0 %	40 %	73663759
51	NC_007351	TAA	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
52	NC_007351	ATC	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
53	NC_007351	CTA	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
54	NC_007351	CTT	3	9	2639	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
55	NC_007351	TTAA	2	8	2695	2702	50 %	50 %	0 %	0 %	73663759
56	NC_007351	ATT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
57	NC_007351	TAT	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
58	NC_007351	TCA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
59	NC_007351	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
60	NC_007351	ACTT	2	8	2810	2817	25 %	50 %	0 %	25 %	73663759
61	NC_007351	ATA	2	6	2884	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
62	NC_007351	T	6	6	2902	2907	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
63	NC_007351	TCT	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
64	NC_007351	ACT	2	6	2928	2933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
65	NC_007351	TTGT	2	8	2940	2947	0 %	75 %	25 %	0 %	73663759
66	NC_007351	ATA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
67	NC_007351	ACT	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
68	NC_007351	ATT	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
69	NC_007351	CTATTA	2	12	3055	3066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73663759
70	NC_007351	TGC	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663759
71	NC_007351	ATT	2	6	3150	3155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
72	NC_007351	CTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
73	NC_007351	CTT	2	6	3191	3196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
74	NC_007351	TTCA	2	8	3243	3250	25 %	50 %	0 %	25 %	73663759
75	NC_007351	CAT	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
76	NC_007351	GCTC	2	8	3397	3404	0 %	25 %	25 %	50 %	73663759
77	NC_007351	GCA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663759
78	NC_007351	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
79	NC_007351	AT	3	6	3534	3539	50 %	50 %	0 %	0 %	73663759
80	NC_007351	TTTA	2	8	3606	3613	25 %	75 %	0 %	0 %	73663759
81	NC_007351	TTC	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
82	NC_007351	TAA	2	6	3663	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
83	NC_007351	TGCT	2	8	3789	3796	0 %	50 %	25 %	25 %	73663759
84	NC_007351	T	6	6	3802	3807	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
85	NC_007351	GT	3	6	3828	3833	0 %	50 %	50 %	0 %	73663759
86	NC_007351	TAA	2	6	3862	3867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
87	NC_007351	T	7	7	3894	3900	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
88	NC_007351	ATC	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
89	NC_007351	ACA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663759
90	NC_007351	GAAG	2	8	4084	4091	50 %	0 %	50 %	0 %	73663759
91	NC_007351	CCT	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663759
92	NC_007351	CAG	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663759
93	NC_007351	AAT	2	6	4159	4164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
94	NC_007351	TTC	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
95	NC_007351	CAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
96	NC_007351	ATT	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663760
97	NC_007351	CTT	2	6	4437	4442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663760
98	NC_007351	CAT	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
99	NC_007351	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
100	NC_007351	GAG	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73663760
101	NC_007351	TCA	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
102	NC_007351	A	6	6	4570	4575	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
103	NC_007351	ATG	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
104	NC_007351	TGA	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
105	NC_007351	AGA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663760
106	NC_007351	TAA	3	9	4675	4683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
107	NC_007351	ATA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
108	NC_007351	ATC	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
109	NC_007351	A	6	6	4719	4724	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
110	NC_007351	ATT	2	6	4828	4833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663760
111	NC_007351	TAA	3	9	4849	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
112	NC_007351	AAAC	2	8	4862	4869	75 %	0 %	0 %	25 %	73663760
113	NC_007351	CTA	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
114	NC_007351	GAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663760
115	NC_007351	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
116	NC_007351	AAAT	2	8	4941	4948	75 %	25 %	0 %	0 %	73663760
117	NC_007351	GAT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
118	NC_007351	TGA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
119	NC_007351	GAT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
120	NC_007351	ATA	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
121	NC_007351	CAAA	2	8	5097	5104	75 %	0 %	0 %	25 %	73663760
122	NC_007351	A	8	8	5124	5131	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
123	NC_007351	GAT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
124	NC_007351	TCC	2	6	5153	5158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663760
125	NC_007351	CAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
126	NC_007351	GAA	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663760
127	NC_007351	ATG	2	6	5190	5195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
128	NC_007351	ACA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
129	NC_007351	AC	3	6	5223	5228	50 %	0 %	0 %	50 %	73663760
130	NC_007351	ATA	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
131	NC_007351	A	6	6	5351	5356	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
132	NC_007351	ATG	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
133	NC_007351	GAT	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
134	NC_007351	AAT	2	6	5411	5416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
135	NC_007351	A	6	6	5480	5485	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
136	NC_007351	CAA	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
137	NC_007351	GAT	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
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